发现配偶有外遇后，可以通过保存财产证明、签订财产协议、要求出轨一方写保证书、主张损害赔偿、向第三者主张赠与无效、申请财产保全等方法保护自己的财产。

保存财产证明

婚后，为了保护自己的财产，可以采取以下措施：

保存好财产的权利证明，比如购买合同等。

可以对个人财产进行公证。

如果是夫妻共同生活所需，尽量不使用个人财产。

签订财产协议

在婚姻关系存续期间，可以通过签订财产协议来保障自己的财产权利。这种协议应在夫妻双方自愿、平等的情况下，采用书面形式约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产的归属。这样的约定对双方具有法律约束力。

要求出轨一方写保证书

在婚姻存续期间，受害一方可以要求出轨一方写保证书，以防止进一步的财产损失。

主张损害赔偿

在离婚诉讼中，受害一方可以主张损害赔偿，并且可以要求对方少分或者不分财产。

向第三者主张赠与无效

受害者一方不论是婚内或者离婚后均可以向第三者主张赠与无效，并进行财产返还。

申请财产保全

在离婚分割财产时，如果能举证证明配偶属于婚姻过错方，可以申请财产保全，依法要求其不分或少分财产，同时可以主张精神抚慰金。

通过上述方法，可以在配偶有外遇的情况下，有效地保护自己的财产不受损失。